Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SYCP1Q15431 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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SYCP1Q15431 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SYCP1Q15431 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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SYCP1Q15431 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SYCP1Q15431 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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