Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RAB35Q15286 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
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RAB35Q15286 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RAB35Q15286 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
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