Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
KARSQ15046 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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