Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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ATP1A4Q13733 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ATP1A4Q13733 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ATP1A4Q13733 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ATP1A4Q13733 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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