Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CACNA1SQ13698 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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