Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
PRPF4BQ13523 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PRPF4BQ13523 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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