Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
TRIM28Q13263 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
TRIM28Q13263 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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