Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HOXD11P31277 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HOXD11P31277 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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