Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PTPRBP23467 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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PTPRBP23467 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PTPRBP23467 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
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