Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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LRRTM2O43300 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
LRRTM2O43300 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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