Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms