Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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HOXD1Q9GZZ0 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
HOXD1Q9GZZ0 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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