Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
UHRF1Q96T88 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
UHRF1Q96T88 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms