Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
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ZBED3Q96IU2 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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ZBED3Q96IU2 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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ZBED3Q96IU2 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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ZBED3Q96IU2 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
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ZBED3Q96IU2 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZBED3Q96IU2 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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