Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
PTPROQ16827 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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