Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HIST2H2ACQ16777 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms