Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HIF1AQ16665 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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