Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDK4Q16654 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDK4Q16654 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.8 ms