Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SGCBQ16585 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SGCBQ16585 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.6 ms