Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
MRPL23Q16540 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC068790.2-201ENST00000602601 557 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
MRPL23Q16540 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms