Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NTRK3Q16288 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms