Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
NKX1-1Q15270 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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