Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
KARSQ15046 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
KARSQ15046 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
KARSQ15046 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
KARSQ15046 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
KARSQ15046 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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