Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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NFIXQ14938 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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NFIXQ14938 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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NFIXQ14938 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NFIXQ14938 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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