Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCINQ13939 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCINQ13939 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CCINQ13939 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCINQ13939 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCINQ13939 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCINQ13939 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms