Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPS1Q13098 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPS1Q13098 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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