Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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NFIAQ12857 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NFIAQ12857 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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