Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
FOXO1Q12778 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
FOXO1Q12778 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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