Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
HMGXB3Q12766 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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HMGXB3Q12766 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
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HMGXB3Q12766 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
HMGXB3Q12766 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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