Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
HOXC5Q00444 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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HOXC5Q00444 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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HOXC5Q00444 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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HOXC5Q00444 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
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HOXC5Q00444 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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HOXC5Q00444 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
HOXC5Q00444 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
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