Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TTF2Q9UNY4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TTF2Q9UNY4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms