Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms