Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG3Q9NT62 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG3Q9NT62 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms