Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DUOX1Q9NRD9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUOX1Q9NRD9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms