Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
INCENPQ9NQS7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INCENPQ9NQS7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms