Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms