Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SCAPERQ9BY12 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCAPERQ9BY12 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms