Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV73

CEP250, Centrosome-associated protein CEP250, humanhuman

Predictions only

Length 2,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP250Q9BV73 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP250Q9BV73 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP250Q9BV73 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms