Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RGPD5Q99666 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms