Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCAF11Q99590 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCAF11Q99590 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms