Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RSF1Q96T23 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RSF1Q96T23 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
RSF1Q96T23 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC33.76■■■■□ 3
RSF1Q96T23 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
RSF1Q96T23 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms