Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSRNP1Q96S65 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSRNP1Q96S65 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms