Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMG1Q96Q15 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMG1Q96Q15 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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