Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ABCC12Q96J65 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ABCC12Q96J65 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms