Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HERVK_113Q902F9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms