Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX54Q8TDD1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX54Q8TDD1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms