Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms