Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMIM5Q71RC9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms