Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXIP1Q6ZW49 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms