Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC144NLQ6NUI1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCDC144NLQ6NUI1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms